Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms