Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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