Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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