Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms