Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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