Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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USP18Q9UMW8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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USP18Q9UMW8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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USP18Q9UMW8 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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USP18Q9UMW8 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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USP18Q9UMW8 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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