Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms