Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RNF20Q5VTR2 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms