Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP194-201ENST00000411328 351 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL357153.2-201ENST00000556646 565 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms