Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLHL12Q53G59 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms