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| UPP1 | Q16831 | CDK1-201 | ENST00000316629 | 1733 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR423-201 | ENST00000362201 | 94 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.311-201 | ENST00000365068 | 96 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | BMP5-201 | ENST00000370830 | 3952 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC119751.3-201 | ENST00000399720 | 670 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AF130351.1-202 | ENST00000400562 | 808 nt | APPRIS P5 TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | SSXP10-201 | ENST00000402595 | 565 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR1183-201 | ENST00000408856 | 89 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC019226.2-201 | ENST00000625973 | 424 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC093908.1-201 | ENST00000623125 | 8092 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | CNOT6L-201 | ENST00000504123 | 8843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | GEN1-201 | ENST00000317402 | 9854 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | ACADM-203 | ENST00000420607 | 1332 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR5BR1P-201 | ENST00000524992 | 1330 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | YWHAZ-201 | ENST00000353245 | 2829 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MCF2-210 | ENST00000536274 | 3461 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIS12-201 | ENST00000381165 | 2505 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR1S2-201 | ENST00000302592 | 978 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | IARS-201 | ENST00000375627 | 697 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | BTBD10P2-201 | ENST00000404779 | 676 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL023807.1-201 | ENST00000407932 | 359 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-55P-201 | ENST00000411092 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-954P-201 | ENST00000411355 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL355989.1-202 | ENST00000419406 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL356361.2-201 | ENST00000430542 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC097478.1-204 | ENST00000509723 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| UPP1 | Q16831 | LINC00944-203 | ENST00000542248 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MRPL42-203 | ENST00000547098 | 701 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL121603.1-201 | ENST00000553815 | 142 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL356022.1-201 | ENST00000557465 | 483 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR4425-201 | ENST00000580572 | 84 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC090616.5-201 | ENST00000581225 | 299 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC00907-210 | ENST00000593316 | 847 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC092364.1-201 | ENST00000598561 | 471 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL357094.1-201 | ENST00000603845 | 844 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL031281.1-201 | ENST00000604049 | 488 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | ESRRAP2-204 | ENST00000606337 | 280 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC112250.2-201 | ENST00000609450 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC244472.2-201 | ENST00000617639 | 406 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | PLCE1-AS2-213 | ENST00000620469 | 432 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC244517.7-201 | ENST00000625144 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | BTG3-AS1-201 | ENST00000626994 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR622-201 | ENST00000638396 | 96 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC010733.2-201 | ENST00000589496 | 5702 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | CPD-202 | ENST00000543464 | 4007 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF804B-202 | ENST00000611114 | 3968 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | HELZ-201 | ENST00000358691 | 13810 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | ANGPTL1-201 | ENST00000234816 | 3348 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | HPGDS-201 | ENST00000295256 | 1636 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| UPP1 | Q16831 | HSPA8P1-201 | ENST00000425843 | 1833 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |