Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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PTPROQ16827 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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PTPROQ16827 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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PTPROQ16827 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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