Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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