Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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SCN9AQ15858 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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SCN9AQ15858 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SCN9AQ15858 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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SCN9AQ15858 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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