Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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PTPRKQ15262 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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PTPRKQ15262 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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PTPRKQ15262 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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PTPRKQ15262 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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