Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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NEDD9Q14511 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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