Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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