Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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