Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms