Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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