Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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