Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ALCAMQ13740 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms