Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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