Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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