Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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