Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFFO1Q0D2I5 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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