Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms