Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms