Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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