Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRMP28827 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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