Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms