Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRZ1P23471 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRZ1P23471 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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