Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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