Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX5Q9H2C1 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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