Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TM6SF1Q9BZW5 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms