Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PRPF18Q99633 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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PRPF18Q99633 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRPF18Q99633 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PRPF18Q99633 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PRPF18Q99633 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PRPF18Q99633 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRPF18Q99633 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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