Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms