Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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