Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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TRAF7Q6Q0C0 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF7Q6Q0C0 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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TRAF7Q6Q0C0 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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TRAF7Q6Q0C0 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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TRAF7Q6Q0C0 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TRAF7Q6Q0C0 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TRAF7Q6Q0C0 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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