Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms