Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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