Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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