Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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PTPROQ16827 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPROQ16827 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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