Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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