Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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