Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RPE65Q16518 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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