Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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