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| CCDC6 | Q16204 | RN7SL489P-201 | ENST00000486185 | 223 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | SMARCA2-229 | ENST00000634781 | 1106 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC244258.1-201 | ENST00000637553 | 1071 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR5T1-201 | ENST00000641368 | 1118 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| CCDC6 | Q16204 | HDX-202 | ENST00000373177 | 2924 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PLPPR4-201 | ENST00000370184 | 4505 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| CCDC6 | Q16204 | GALNT1-201 | ENST00000269195 | 3847 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ARHGAP28-202 | ENST00000314319 | 5415 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC109315.1-201 | ENST00000584143 | 1347 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ZNF92-204 | ENST00000450302 | 2957 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR1E2-201 | ENST00000248384 | 972 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | KCNE2-201 | ENST00000290310 | 1051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | ZNF788-202 | ENST00000397759 | 777 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPL31P52-201 | ENST00000407532 | 367 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU2-6P-201 | ENST00000411404 | 190 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL365356.1-201 | ENST00000411512 | 736 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |