Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SCN9AQ15858 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SCN9AQ15858 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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SCN9AQ15858 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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