Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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