Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms